一張全基因組育種芯片上均勻分布超12萬個基因位點,檢出率和檢測準確率超99%,技術達國際先進水平……12日在第三十屆中國北京種業大會上,荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片發布,標志著我國荷斯坦牛中高密度育種芯片自主設計開發取得重要突破。
荷斯坦牛是當前世界奶牛的主要品種,作為單胎大型動物,選擇出優秀種公牛是奶牛育種的核心工作。
近年來,國際上已進入奶?;蚪M選擇育種時代,使用中高密度育種芯片,能使種公牛培育周期由約6年縮短至約2年,育種效率顯著提升。
第三十屆中國北京種業大會上展出的荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片。新華社記者丁靜 攝
“十四五”國家重點研發計劃項目首席科學家、中國農業大學教授孫東曉說,我國近年來加速構建和優化奶?;蚪M選擇育種技術平臺,但過去完全依賴國外育種芯片,國內種牛檢測樣品需要送到國外實驗室檢測,存在技術“卡點”及生物信息安全風險。
2020年,首農食品集團北京奶牛中心、中國農業大學、華智生物技術有限公司啟動荷斯坦牛育種芯片自主開發聯合攻關,基于過去多年的科研成果,挖掘、鑒定了一批針對我國荷斯坦牛群體遺傳背景的基因位點,自主設計了涵蓋超12萬個位點(即126K)的育種芯片,可通過牛的毛發或血液等,檢出基因突變位點、遺傳缺陷位點、親子鑒定位點、其他多組學來源數據位點等。
近日,專家組論證認為,芯片設計科學合理,驗證程序完善,參照國際同類產品標準,達到產業化推廣應用水平,可用于荷斯坦牛基因組選擇參考群體的構建及種牛評價。
“這是我國荷斯坦牛育種領域首款中高密度育種芯片,對提升我國種公牛自主培育能力和水平,進一步完善奶牛種質自主評價體系具有重要意義?!敝袊虡I協會副秘書長陳紹祜說。
中國奶業協會育種專業委員會主任麻柱說,奶牛育種自主創新聯盟將率先用上這款芯片,助力保障我國奶牛自主選育體系穩定運行,維護生物信息安全。